ברפואת האלטרנטיבית רואים את הטיפול באלרגיה עונתית בצורה קצת שונה, הם מבינים שיש מקור לבעיה של אלרגיה עונתית, והוא חולשה של מערכת החיסון, מערכת העיכול ודרכי הנשימה.

לדוגמא:ברפואה הסינית מערכת העיכול היא הבסיס של מערכת החיסון, ובעזרת חיזוק של הגוף והעיכול ניתן לטפל באלרגיה עונתית ובנזלת אלרגית. ברפואה הסינית שמדברים על מערכת העיכול מדברים על אלמנט האדמה , אלמנט האדמה גם קשור לעונות המעבר וליכולת של הגוף ליצור שינויים, ולא במקרה אנחנו רואים כשמעכרת העיכול חלשה, התסמינים מתגברים,גם ללא קשר לחשיפה לאלרגנים.